Pliki dowodowe można znaleźć metodami wyszukiwania. Wykryty dowód nie jest dostępny, jeśli jest zaszyfrowany . W ten sposób szyfrowanie staje się kolejnym rodzajem techniki antyforenologicznej. Opracowano narzędzie antyforensyczne wykorzystujące metodologię szyfrowania . Istnieje wiele algorytmów szyfrowania, takich jak XOR, Blowfish, AES i RSA. Silne i dobre algorytmy szyfrowania są łatwe do nadużycia i utrudniają analizę kryminalistyczną ze względu na zarządzanie kluczami. Szyfrowanie może być stosowane w komunikacji sieciowej, co utrudnia analizę sieci. Na przykład zaszyfrowane pakiety są trudne do przeanalizowania przez sieciowe narzędzia kryminalistyczne.