Zarządzanie lukami w oprogramowaniu jest trudnym zadaniem, ponieważ staje się ono coraz większe. Zarządzanie ryzykiem w oprogramowaniu jest trudnym zadaniem przede wszystkim ze względu na trzy czynniki – złożoność, rozszerzalność i łączność. Systemy wbudowane zwykle zalecają stosowanie języków programowania, takich jak C lub C ++, ponieważ wydajność i wykorzystanie takich niezarządzanych języków programowania prowadziłoby do kilku luk w zabezpieczeniach, takich jak przepełnienie bufora. Gdy te podatne aplikacje łączą się z Internetem, stają się one bardziej złożone, tak że luki stają się trudne do przewidzenia. Rozszerzalność to kolejny czynnik, który sprawia, że system jest podatny na atak. Nowoczesne oprogramowanie zbudowane przy użyciu java i .NET można łatwo rozszerzyć poprzez dodanie zewnętrznych modułów / funkcjonalności, które mogą być złośliwe. W miarę jak coraz więcej systemów wbudowanych jest podłączanych do Internetu, problemy / awarie zaczynają rozprzestrzeniać się na całą sieć i powodują ogromne szkody. Jest tak wiele innych defektów oprogramowania, które narażają system wbudowany na ataki. Infekcja spowodowana wirusem sprzętowym w systemie wbudowanym utrzymuje się nawet po ponownym uruchomieniu systemu lub ponownej instalacji systemu. Hakerzy mogą wstrzyknąć swój kod do pamięci Flash ROM systemu, a następnie przejąć kontrolę nad systemem. Czasami infekcja może nie zmienić normalnego działania systemu, ale może przekazać systemowi fałszywe dane. Większość chipów flash-ROM nie jest w pełni wykorzystywana, co daje hakerom wystarczająco dużo miejsca na przechowywanie informacji o tylnych drzwiach i wirusach. Środki zaradcze powinny rozpoczynać się od samego modelu cyklu życia oprogramowania. Większość ludzi traci troskę o bezpieczeństwo i koncentruje się na funkcjonalności systemu. Środki bezpieczeństwa powinny być stosowane na poziomie wymagań, poziomie projektu i poziomie kodu. Dostępne są narzędzia do analizy statycznej, które pozwalają wykryć błędy implementacji w kodzie. Zdając sobie sprawę ze znaczenia bezpieczeństwa, teraz praktycy zaczęli stosować najlepsze praktyki w zakresie wbudowanych zabezpieczeń.